秘書處業務於創校之初由校長室秘書綜合處理，其後伴隨學校校務蒸蒸日上，行政業務擴增，乃於1966年設置秘書室，至1990年為配合部訂大學組織規程正式編制為秘書處。歷任主任秘書為張萬涵、王德新、陳德昭、張世祿、鈕則誠、王祿旺、金鑫、洪孟啟、陳振南等，現任主任秘書為樊中原。

秘書處自建制以來在諸位先進盡心奉獻，努力營造之下，為學校制度典章奠立堅實基礎，傳承優良工作傳統，協同各單位推動校務並日漸精進。

秘書處為直屬校長之行政一級單位，由一群具有服務熱忱的工作團隊組成，在主任秘書帶領下，秉承校長的指示，協助本校各行政、教學單位順利推動業務，並辦理文書、校友聯絡、新聞、公共關係等事務，以促進校務協調統整、和諧團結。為此秘書處同仁必須具有強烈的責任感，誠摯的服務心與高度的榮譽感，以及先公後私為校奉獻的自我期許。